Дополнительные материалы к курсу «Молекулярная биология»

Трансляция - рибосомальный синтез белка
Аминоацил-тРНК синтетаза I класса Аминоацил-тРНК синтетаза класса I (глютаминил-тРНК синтетаза) PDB ID: 1QRS \| инфо
Аминоацил-тРНК синтетаза II класса Аминоацил-тРНК синтетаза класса II (аспартил-тРНК синтетаза) PDB ID: 1ASZ \| инфо
30S субчастица прокариотической рибосомы 30S субчастица рибосомы Thermus thermophilus PDB ID: 1J5E \| инфо
50S субчастица прокариотической рибосомы 50S субчастица рибосомы Haloarcula marismortui PDB ID: 1Q7Y \| инфо
30S субчастица и тРНК в сайтах A, P и E 30S субчастица и тРНК в сайтах A, P и E PDB ID: 1JGO \| инфо
Распознавание последовательности SD в 70S рибосоме Распознавание последовательности SD в 70S рибосоме PDB ID: 4V4J \| инфо
Распознавание последовательности SD в 70S рибосоме Распознавание последовательности SD в 70S рибосоме PDB ID: 4V5G \| инфо
Факторы инициации IF-1, IF-2 и тРНК Факторы инициации IF-1, IF-2 и тРНК PDB ID: 1ZO1 \| инфо
Комплекс EF-Tu с тРНК и ГТФ Комплекс EF-Tu с тРНК и ГТФ PDB ID: 1B23 \| инфо
Фактор терминации RF-1 Фактор терминации RF-1 PDB ID: 1ZBT \| инфо
Фактор терминации RF-2 Фактор терминации RF-2 PDB ID: 1GQE \| инфо
Фактор терминации RRF Фактор терминации RRF PDB ID: 1EK8 \| инфо
Шаперонин GroEL/GroES Шаперонин GroEL/GroES PDB ID: 1AON \| инфо
Процессинг первичных РНК-транскриптов
Молекулярные механизмы копирования полинуклеотидов
Организация бактериальных и эукариотических геномов
Структура нуклеиновых кислот
A-форма ДНК Теоретическая модель PDB ID: \| инфо
B-форма ДНК Кристаллическая структура додекамера ДНК d(CpGpCpGpApApTpTpCpGpCpG) PDB ID: 1BNA \| инфо
Z-форма ДНК ДНК Z-формы – левозакрученная зигзагообразная структура PDB ID: 3ZNA \| инфо
Водородные связи в ДНК (B-форма) Шаг двойной спирали ДНК PDB ID: \| инфо
H-форма ДНК Тройная спираль ДНК PDB ID: 1BCE \| инфо
Переход B-формы ДНК в ДНК Z-формы В месте перехода B-ДНК » Z-ДНК два азотистых основания вытеснены в стороны PDB ID: 1ACJ \| инфо
Топоизомераза I Топоизомераза I Homo sapiens в комплексе с ДНК PDB ID: 1RRJ \| инфо
Топоизомераза IIa Топоизомераза IIa Homo sapiens в комплексе с ДНК PDB ID: 1ZXN \| инфо
Топоизомераза IV Субъединица A топоизомеразы IV E. coli PDB ID: 1ZVU \| инфо
Гираза (субъединица B) Субъединица B гиразы E. coli PDB ID: 1EI1 \| инфо
Рестриктаза EcoRI Рестриктаза EcoRI из E. coli PDB ID: 1QPS \| инфо
Cas9 Cas9 bound to PAM-containing DNA target PDB ID: 4UN3 \| инфо

#	Название	ID	URL	Короткий URL
	Введение в методы получения структур биомолекул
1	Синтетический белок	1vye	открыть
2	Синтетический белок	1rik	открыть
3	Миоглобин (рентгеноструктурный анализ)	1a6m	открыть
4	Миоглобин (ЯМР)	1myf	открыть
	Электрон-транспортная цепь в митохондриях
5	Комплекс I	4hea	открыть
6	Комплекс II	1nek	открыть
7	Комплекс III	1bgy	открыть
8	Комплекс IV	1qle	открыть
9	Цитохром C	3cyt	открыть
10	Большая субъединица прокариотической рибосомы	1ffk	открыть
	Молекулярная структура фотосистем растений
11	Фотосистема II	1s5l	открыть	goo.gl/mIjPy
12	Светособирающий комплекс II	2bhw	открыть	goo.gl/s2f5d
13	Фикобилипротеин	2bv8	открыть	goo.gl/YgmsM
14	Цитохром b₆/f	1um3	открыть	goo.gl/b3krl
15	Пластоцианин	2pcf	открыть	goo.gl/91PTW
16	Фотосистема I	1jb0	открыть	goo.gl/YWXf2
17	Ферредоксин	1a70	открыть	goo.gl/ucHTe
18	АТФ-синтаза, субъединица F0	1c17	открыть
19	АТФ-синтаза, субъединица F1	1e79	открыть
20	Бактериальная фотосистема из пурпурной бактерии	1prc	открыть	goo.gl/KJd2Y
21	Ферредоксин	1a70	открыть	goo.gl/ucHTe
22	Фотосистема II	1s5l	открыть	goo.gl/mIjPy
	Структура рецепторных молекул растений
23	Фитохром Б	1jnu	открыть	goo.gl/LbiVm
24	Криптохром	1u3d	открыть	goo.gl/hEQgU
25	TIR1 – Ядерный рецептор ауксина	2p1q	открыть	goo.gl/V3a3b
26	ABP1 – цитоплазматический рецептор ауксина	1lrh	открыть	goo.gl/z3l4A
27	AHK4 – рецептор цитокинина	3t4l	открыть	goo.gl/PK1Mf
28	GID1 – рецептор гиббереллина	2zsh	открыть	goo.gl/sUwqA
29	BRI1 – рецептор брассиностероидов	3rj0	открыть	goo.gl/vERQ6
30	Рецептор жасмоновой кислоты	3ogl	открыть	goo.gl/E3MoT
31	PYR1 – рецептор абсцизовой кислоты	3k90	открыть	goo.gl/7ApA6
32	Кальмодулин	1cll	открыть	goo.gl/9ObY4
33	Кальмодулин в комплексе с CDPK	1cm1	открыть
34	Гомеодомен в комплексе с ДНК	1b8i	открыть	goo.gl/Qlhwu
35	Домен „лейциновые молнии“ в комплексе с ДНК	1nwq	открыть	goo.gl/jgA28
36	Домен bHLH в комплексе с ДНК	1a0a	открыть	goo.gl/ZlFLV
37	Домен „цинковые пальцы“ (TATA-мотив) в комплексе с ДНК	1g2d	открыть	goo.gl/5G0G8
	Структура нуклеиновых кислот
38	A-форма ДНК	molbio_dnaaform	открыть
39	B-форма ДНК	molbio_dnabform	открыть
40	Z-форма ДНК	molbio_dnazform	открыть
41	Водородные связи в ДНК (B-форма)	molbio_dnahbonds	открыть
42	H-форма ДНК	molbio_dnahform	открыть
43	Переход B-формы ДНК в ДНК Z-формы	molbio_dnaz2b	открыть
44	Топоизомераза I	molbio_top1	открыть
45	Топоизомераза IIa	molbio_top2	открыть
46	Топоизомераза IV	molbio_gyrase	открыть
47	Гираза (субъединица B)	molbio_gyraseb	открыть
48	Рестриктаза EcoRI	molbio_ecori	открыть
49	Cas9	molbio_cas9	открыть
	Организация бактериальных и эукариотических геномов
	Молекулярные механизмы копирования полинуклеотидов
	Процессинг первичных РНК-транскриптов
	Трансляция - рибосомальный синтез белка
50	Аминоацил-тРНК синтетаза I класса	1qrs	открыть
51	Аминоацил-тРНК синтетаза II класса	1asz	открыть
52	30S субчастица прокариотической рибосомы	1j5e	открыть
53	50S субчастица прокариотической рибосомы	1q7y	открыть
54	30S субчастица и тРНК в сайтах A, P и E	1jgo	открыть
55	Распознавание последовательности SD в 70S рибосоме	4v4j	открыть
56	Распознавание последовательности SD в 70S рибосоме	4v5g	открыть
57	Факторы инициации IF-1, IF-2 и тРНК	1zo1	открыть
58	Комплекс EF-Tu с тРНК и ГТФ	1b23	открыть
59	Фактор терминации RF-1	1zbt	открыть
60	Фактор терминации RF-2	1gqe	открыть
61	Фактор терминации RRF	1ek8	открыть
62	Шаперонин GroEL/GroES	1aon	открыть
	01 – Введение
63	2 нуклеосомы шпорцевой лягушки Xenopus laevis	lnmo_1zbb	открыть
64	Нуклеосома шпорцевой лягушки Xenopus laevis	lnmo_1aoi	открыть
65	Синтетический белок	lnmo_1vye	открыть
66	α-спираль / ферритиноподобный белок	lnmo_1bcf	открыть
67	Гомеодомен-подобный белок	lnmo_1enh	открыть
68	Иммуноглобулин-подобный β-сэндвич	lnmo_1cd8	открыть
69	Четырёхлопастной β-пропеллер	lnmo_1pex	открыть
70	Одноцепочечная левозакрученная β-спираль	lnmo_1lxa	открыть
71	β-призма II	lnmo_1jpc	открыть
72	α/β-структура	lnmo_1pfk	открыть
73	α+β-структура	lnmo_2pil	открыть
74	α+β-структура – GFP-подобная	lnmo_1ema	открыть
	02 – Нуклеиновые кислоты
75	Цитидин	lnmo_cytidine	открыть
76	Водородные связи в ДНК (B-форма)	lnmo_dnahbonds	открыть
77	A-форма ДНК	lnmo_dnaaform	открыть
78	B-форма ДНК	lnmo_dnabform	открыть
79	Z-форма ДНК	lnmo_dnazform	открыть
80	H-форма ДНК	lnmo_dnahform	открыть
81	Квадруплексная структура ДНК	lnmo_dnaqform	открыть
82	РНК-шпилька	lnmo_1ylg	открыть
83	Тиминовый димер в ДНК	lnmo_1ttd	открыть
84	Репарация тиминового димера фотолиазой	lnmo_1tez	открыть
85	тРНК	lnmo_1tra	открыть
86	TATA-бокс связывающий белок	lnmo_1tgh	открыть
87	Компонент энхансосомы	lnmo_1t2k	открыть
88	Гомеодомен в комплексе с ДНК	lnmo_1b8i	открыть	goo.gl/Qlhwu
89	Домен „лейциновые молнии“ в комплексе с ДНК	lnmo_1nwq	открыть	goo.gl/jgA28
90	Домен bHLH в комплексе с ДНК	lnmo_1a0a	открыть	goo.gl/ZlFLV
91	Домен „цинковые пальцы“ (TATA-мотив) в комплексе с ДНК	lnmo_1g2d	открыть
92	Рестриктаза EcoRI в комплексе с одноцепочечной ДНК	lnmo_1qps	открыть
	03 – Запасные и транспортные белки I
93	Миоглобин (рентгеноструктурный анализ)	lnmo_1a6m	открыть
94	Гемоглобин	lnmo_1hho	открыть
95	Эритрокруорин	lnmo_2gtl	открыть
96	Ферритин	lnmo_3is7	открыть
97	Трансферрин	lnmo_1h76	открыть
98	Сидерофор	lnmo_4k19	открыть
99	Липопротеин липовителлин	lnmo_1lsh	открыть
	04 – Биологические мембраны и транспортные белки II
100	Холестерол	lnmo_cholesterol	открыть
101	Липидная мицелла	lnmo_m65	открыть
102	Кристаллическая структура липидного бислоя	lnmo_popc-crystal	открыть
103	Гелеобразная структура липидного бислоя	lnmo_popc-gel	открыть
104	Жидкая структура липидного бислоя	lnmo_popc-fluid	открыть
105	Бактериородопсин, встроенный в липидный бислой	lnmo_popc-br	открыть
106	Мембранный белок FepA	lnmo_1fep	открыть
107	Рецептор сидерофора FauA	lnmo_3efm	открыть
108	Мальтопорин	lnmo_1mal	открыть
109	α-Хемолизин	lnmo_7ahl	открыть
110	Кальциевая АТФаза	lnmo_1su4	открыть
111	Аквапорин	lnmo_2abm	открыть
112	Na-K-насос	lnmo_2zxe	открыть
	05 – Биологическая сигнализация
113	Ацетилхолиновый рецептор	lnmo_2bg9	открыть
114	Ацетилхолин-связывающий белок	lnmo_1uv6	открыть
115	Ацетилхолин-связывающий белок в комплексе с α-кобратоксином	lnmo_1yi5	открыть
116	Инсулин	lnmo_4ins	открыть
117	Рецепторный домен рецептора инсулина	lnmo_2dtg	открыть
118	Рецепторный домен рецептора инсулина в комплексе с инсулином	lnmo_3w14	открыть
119	Трансмембранный домен рецептора инсулина	lnmo_2mfr	открыть
120	Тирозинкиназный домен рецептора инсулина (неактивный)	lnmo_1irk	открыть
121	Тирозинкиназный домен рецептора инсулина	lnmo_1ir3	открыть
122	G-белок	lnmo_1gg2	открыть
123	Кальмодулин	lnmo_1cll	открыть
124	Кальмодулин в комплексе с CDPK	lnmo_1cm1	открыть
	06 – Рецепция гормонов
125	Адренэргический рецептор	lnmo_2rh1	открыть
126	Родопсин	lnmo_1f88	открыть
127	TIR1 – Ядерный рецептор ауксина	lnmo_2p1q	открыть	goo.gl/V3a3b
128	Рецептор эстрогена (лиганд-связывающий домен)	lnmo_1a52	открыть
129	Рецептор эстрогена (ДНК-связывающий домен)	lnmo_1hcq	открыть
130	BRI1 – рецептор брассиностероидов	lnmo_3rj0	открыть	goo.gl/vERQ6
	07 – Механизм действия лекарств
131	Рецептор эстрогена, связанный с тамоксифеном	lnmo_3ert	открыть
132	Рецептор серотонина, связанный с эрготамином	lnmo_4iar	открыть
133	MDR-транспортёр	lnmo_2onj	открыть
	08 – Структурные белки
134	Актин	lnmo_1atn	открыть
135	Актин в комплексе с гельзолином	lnmo_1yvn	открыть
136	Актин в комплексе с профилином	lnmo_1hlu	открыть
137	Актин в комплексе с миозином	lnmo_1alm	открыть
138	Кадгерин	lnmo_1l3w	открыть
139	Коллаген	lnmo_1bkv	открыть
140	Бактериальный микрокомпартмент	lnmo_2zv5	открыть
141	Шаперонин GroES/GroEL	lnmo_1aon	открыть
	09 – Фотосинтез
142	Фотосистема II	lnmo_1s5l	открыть	goo.gl/mIjPy
143	Светособирающий комплекс II	lnmo_2bhw	открыть	goo.gl/s2f5d
144	Фикобилипротеин	lnmo_2bv8	открыть	goo.gl/YgmsM
145	Цитохром b₆/f	lnmo_1um3	открыть	goo.gl/b3krl
146	Пластоцианин	lnmo_2pcf	открыть	goo.gl/91PTW
147	Фотосистема I	lnmo_1jb0	открыть	goo.gl/YWXf2
	10 – Молекулярные машины
148	АТФ-синтаза, субъединица F0	lnmo_1c17	открыть
149	АТФ-синтаза, субъединица F1	lnmo_1e79	открыть
150	26S протеасома	lnmo_4cr2	открыть

Трансляция - рибосомальный синтез белка
Аминоацил-тРНК синтетаза I класса Аминоацил-тРНК синтетаза класса I (глютаминил-тРНК синтетаза) PDB ID: 1QRS \| инфо
Аминоацил-тРНК синтетаза II класса Аминоацил-тРНК синтетаза класса II (аспартил-тРНК синтетаза) PDB ID: 1ASZ \| инфо
30S субчастица прокариотической рибосомы 30S субчастица рибосомы Thermus thermophilus PDB ID: 1J5E \| инфо
50S субчастица прокариотической рибосомы 50S субчастица рибосомы Haloarcula marismortui PDB ID: 1Q7Y \| инфо
30S субчастица и тРНК в сайтах A, P и E 30S субчастица и тРНК в сайтах A, P и E PDB ID: 1JGO \| инфо
Распознавание последовательности SD в 70S рибосоме Распознавание последовательности SD в 70S рибосоме PDB ID: 4V4J \| инфо
Распознавание последовательности SD в 70S рибосоме Распознавание последовательности SD в 70S рибосоме PDB ID: 4V5G \| инфо
Факторы инициации IF-1, IF-2 и тРНК Факторы инициации IF-1, IF-2 и тРНК PDB ID: 1ZO1 \| инфо
Комплекс EF-Tu с тРНК и ГТФ Комплекс EF-Tu с тРНК и ГТФ PDB ID: 1B23 \| инфо
Фактор терминации RF-1 Фактор терминации RF-1 PDB ID: 1ZBT \| инфо
Фактор терминации RF-2 Фактор терминации RF-2 PDB ID: 1GQE \| инфо
Фактор терминации RRF Фактор терминации RRF PDB ID: 1EK8 \| инфо
Шаперонин GroEL/GroES Шаперонин GroEL/GroES PDB ID: 1AON \| инфо
Процессинг первичных РНК-транскриптов
Молекулярные механизмы копирования полинуклеотидов
Организация бактериальных и эукариотических геномов
Структура нуклеиновых кислот
A-форма ДНК Теоретическая модель PDB ID: \| инфо
B-форма ДНК Кристаллическая структура додекамера ДНК d(CpGpCpGpApApTpTpCpGpCpG) PDB ID: 1BNA \| инфо
Z-форма ДНК ДНК Z-формы – левозакрученная зигзагообразная структура PDB ID: 3ZNA \| инфо
Водородные связи в ДНК (B-форма) Шаг двойной спирали ДНК PDB ID: \| инфо
H-форма ДНК Тройная спираль ДНК PDB ID: 1BCE \| инфо
Переход B-формы ДНК в ДНК Z-формы В месте перехода B-ДНК » Z-ДНК два азотистых основания вытеснены в стороны PDB ID: 1ACJ \| инфо
Топоизомераза I Топоизомераза I Homo sapiens в комплексе с ДНК PDB ID: 1RRJ \| инфо
Топоизомераза IIa Топоизомераза IIa Homo sapiens в комплексе с ДНК PDB ID: 1ZXN \| инфо
Топоизомераза IV Субъединица A топоизомеразы IV E. coli PDB ID: 1ZVU \| инфо
Гираза (субъединица B) Субъединица B гиразы E. coli PDB ID: 1EI1 \| инфо
Рестриктаза EcoRI Рестриктаза EcoRI из E. coli PDB ID: 1QPS \| инфо
Cas9 Cas9 bound to PAM-containing DNA target PDB ID: 4UN3 \| инфо